На сегодня, по данным Комитета гражданской авиации (КГА) доля гражданской авиации в общих транспортных перевозках республики составляет всего 0,12%. Тем не менее, доля внутренних авиаперевозок остается относительно большой, почти 40% от общего объема. Только между Алматы и Астаной — старой и новой столицами — ежедневно совершается 6 пассажирских рейсов.
В рамках программы развития гражданской авиации предполагается провести реорганизацию авиационной администрации Казахстана, разработать и внедрить системы конкурсного назначения авиакомпаний на все внутренние регулярные рейсы, а также лицензирования деятельности по продаже авиаперевозок в соответствии с международными стандартами. Программой предусмотрена реорганизация внутренней маршрутной сети, в том числе открытие рейсов Астана - Павлодар, Астана – Костанай - Уральск, Астана - Атырау, Атырау - Уральск, Усть-Каменогорск - Шымкент и некоторых других.