Основной целью деятельности ИЛЦ является международное информационное обеспечение транспортно-логистических процессов на базе единого информационно-правового пространства путем электронного обмена данными, отвечающими требованиям международных стандартов и рекомендаций, между всеми участниками интермодальных перевозок на базе применения современных технологий автоматической идентификации, электронного обмена данными и документами, базирующимися на международных нормативно-правовых документах, единой базой нормативно-справочной информации и информационных технологиях коллективного доступа.
ИЛЦ осуществляет информационную поддержку деятельности участников по перевозке грузов с организацией логистических цепочек и ведение контроля за грузовыми перевозками различными видами транспорта.
Важнейшая цель создания ИЛЦ – получение коммерческой выгоды за счет разработки и организации оптимальных схем грузовых перевозок всеми видами транспорта по территории России и других государств на основе организации единого технологического и информационного процесса, объединяющего деятельность всех видов транспорта по обеспечению перевозок грузов и оказанию сопутствующих услуг.
ИЛЦ обеспечивает взаимодействие разработанных автоматизированных систем управления на транспорте, созданных информационных хранилищ баз данных с транспортными и экспедиторскими компаниями, грузоперерабатывающими центрами, таможенных, пограничных и иных служб контроля и проверки, страховых, информационно-нормативных, финансовых и других участников интермодальных перевозок.